tworzona w oparciu o techniki decyzyjne, modele Markova, DES i inne metody modelowania
W ramach analizy ekonomicznej oceniana jest opłacalność stosowania danej technologii medycznej względem technologii alternatywnych w warunkach polskich (lub zagranicznych w zależności od miejsca składania wniosku refundacyjnego). Opracowywana jest w oparciu o dane zebrane w ramach analizy klinicznej oraz przy uwzględnieniu dodatkowych źródeł danych. Analiza ekonomiczna obejmuje analizę kosztów porównywanych technologii medycznych naliczanych z wybranej perspektywy, najczęściej perspektywy płatnika publicznego oraz łącznej perspektywy płatnika publicznego i pacjentów przy uwzględnieniu współpłacenia za leki. Opłacalność interwencji wyrażana jest najczęściej przez koszt uzyskania dodatkowego efektu zdrowotnego za pomocą technologii badanej względem technologii opcjonalnych.